RP-modifizierte Platten dienen zwei Zwecken: Sie dienen als Pilotmethode für die HPLC und ermöglichen die Auswahl verschiedener Lösungsmittelsysteme für spezielle Trennungen. RP-modifizierte Siliziumdioxidschichten von Merck Millipore eignen sich gut für viele Trennungsherausforderungen, die unmodifiziertes Siliziumdioxid nicht bewältigen kann. Diese Schichten verwenden wässrige Lösungsmittelsysteme zur Trennung extrem unpolarer Substanzen und zur Analyse bestimmter polarer Substanzen, die sich an die Ionenpaarchromatographie anpassen können. Darüber hinaus sind RP-modifizierte Silikaschichten weniger abhängig von der Luftfeuchtigkeit. Im Gegensatz zu unmodifiziertem Siliciumdioxid weisen RP-Phasen keine katalytische Aktivität auf. Das macht sie zur ersten Wahl für instabile Substanzen, die zu oxidativem Abbau neigen.